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[分享] 何谓「分散式计算」及「常见问题」  (2008.10月版)
  「分散式计算」是一种把需要进行大量计算的工程数据分割成小块,由多台电脑分别计算,在上传运算结果后再统一合并得出数据结论的科学。目前主流的分散式计算平台,"伯克利开放式网路计算平台(Berkeley Open Infrastructure for Network Computing,简称BOINC)",由加州大学柏克莱分校的电脑学系发展出来的分散式计算系统。

  目前常见的分散式计算项目有,分析地球外无线电信号,从而搜索地球外的生命迹象的SETI@home项目,该项目数据基数很大,超过1000万位数的质数,是目前世界上最大的分散式计算项目,已有四百万台电脑加入了此项;同时也有分析计算蛋白质的内部结构和相关药物的Folding@home项目,该项目大约有十万余志愿者参加。其他如(星尘的分检、计算圆周率、疫苗、制药、数学、密码、气象、生态、环境、物理推算、蛋白质、基因等......)。

  这些项目很庞大,需要惊人的计算量,由一台电脑计算是不可能完成的。即使现在有了计算能力超强的超级电脑,但是一些科研机构的经费却又十分有限。通常使用世界各地上千万志愿者电脑的闲置计算能力,通过网际网路进行数据传输演算。
(以检验所有人类染色体为例,它需要一台最先进的 PC 1,000,000 年的计算时间)


  「Mychat数位男女」目前所参与的WorldCommunityGrid (WCG) (世界公共网格)是一个由 IBM 公司资助的公益性的医学研究项目平台。

  该平台目前正在运行的项目如下:
  正在进行中的研究

    1、「全球营养水稻」(Nutritious Rice for the World)(于 2008 年 05 月 12 日启动)
World Community Grid 「全球营养水稻」项目提供的计算能力将用于帮助编译一些计算模块,这些模块有助于确定能最大程度地提高水稻产量和质量的最佳选项。 [详细内容]

    2、「征服癌症」(Help Conquer Cancer)(于 2007 年 11 月 06 日启动)
Ontario Cancer Institute(OCI)、Princess Margaret Hospital 以及 University Health Network 与 World Community Grid 在推动 X 射线晶体学的研究成果方面进行合作,以便增进对癌症及其治疗方法的理解。[详细内容]

    3、「气候系统分析团队」( AfricanClimate@Home)(于 2007 年 09 月 03 日启动)
World Community Grid 与 University of Cape Town「气候系统分析团队」的研究人员进行合作,为非洲的特定区域开发更为精确的气候模型。这项研究成果将作为理解气候在未来如何变化的基础,以便使旨在减轻气候变化负面影响的措施得以更好地实施。[详细内容]

    4、「发现治疗登革热的药物」(Discovering Dengue Drugs - Together)(于 2007 年 08 月 21 日启动)
来自 University of Texas 医学分部和 University of Chicago 的科学家已经加入到 World Community Grid 研究人员的行列,共同与在发达和发展中国家或地区传播最为广泛的一些病毒性疾病作斗争。该项目的短期目标是发现能够治疗登革出血热、丙型肝炎、西尼罗脑炎和黄热病的最新药物;这些疾病都是由黄病毒科病毒感染所引起的[详细内容]

    5、「人类蛋白质组折叠」(Human Proteome Folding)-第 2 阶段(于 2006 年 06 月 23 日启动)
「人类蛋白质组折叠」第 2 阶段(HPF2)是第一阶段的延续。这个项目的两个主要目标是:1)获得特定人类蛋白质和病原体蛋白质更为精细的结构 2)通过进一步开发 Rosetta 软件结构预测功能,进一步提高蛋白质结构预测的准确性。[详细内容]

    6、「FightAIDS@Home」(于 2005 年 11 月 21 日启动)
FightAIDS@Home 项目注重于使用计算方法来确定具有正确的分子外形和化学特征的新候选药物,以用于抑制 HIV 蛋白酶。这种方法被称为「基于结构的药物设计」,根据 National Institute of General Medical Sciences 的调查,这种方法已经对爱滋病人产生了神奇的效果。详细内容
  暂停中的研究

    「治疗肌肉萎缩症」(Help Cure Muscular Dystrophy)(于 2006 年 12 月 19 日启动)
World Community Grid 和 Decrypthon 支持的研究人员合作研究 4 万多种结构已知的蛋白质分子之间的相互作用,特别关注在神经肌肉疾病方面起作用的蛋白质,Decrypthon 是 AFM(French Muscular Dystrophy Association)、CNRS(French National Center for Scientific Research)和 IBM 进行的一项合作研究。这个项目所产生的信息数据库将帮助研究人员设计分子以抑制或增强特定高分子的结合,希望能发现治疗肌肉萎缩症及其他神经肌肉疾病的更好方法。


官方网站:http://www.worldcommunitygrid.org
中国网站:http://www.equn.com/wcg/
官方论坛:http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/index

请注意:Your member name can contain alphanumeric characters (A-Z, 0-9), and !, -, _, and spaces. (注册时使用的用户名能包括以下字符:A~Z、a~z、0~9、! 、- 、_ 和空格。)

特别提示:
1、该平台对内存的占用量比较大,尤其是“FightAIDS@Home”和“Help Defeat Cancer”子项目,所以如果您的电脑暂存小于 512MB,建议您参加其他的医药类项目。
2、WCG 核心运算在默认设置下是占用 60% 的 CPU,如果需要调整 CPU 使用率,请配合使用 WCGridMaxCPU.exe 程式。下载地址:http://www.worldcommunitygrid....ridMaxCPU.exe



目前较大且稳定的科学研究项目
Einstein@Home:于2005年(定为世界物理年)的这一年开始的计划,预计是要找出脉冲星的重力波,验证爱因斯坦的相对论预测。
LHC@home:由欧洲核子研究中心发起。演算粒子物理实验及粒子物理学所产生数据。
Predictor@home:由美国 Scripps 研究学会发起。研究蛋白质序列来预测蛋白质结构的分散式计算项目。
Rosetta@home:由美国华盛顿大学发起。是一项关于准确预测和设计蛋白质结构及聚合物的分散式计算项目。其目的即寻找准确预测和设计蛋白质结构及聚合物的方法。
SETI@home:由美国加州大学伯克利分校的空间科学实验室主办。分析(波多黎各岛)阿雷西博无线电望远镜采集的无线电信号,搜寻能够证实外星智能生物存在的证据。

WCG 宣传视频:


[ 此文章被Fielding在2008-10-04 21:05重新编辑 ]

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财富:500 (by mickey97) | 理由: 感谢您大力的协助....呜~~~~~~(眼角泛着泪光)



献花 x3 回到顶端 [楼 主] From:台湾中华HiNet | Posted:2007-05-12 10:07 |
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「分散式计算」常见问题
问(01):「分散式计算」伺服现象状况


问(02):任务的选择,是不是随机的呢?
:理论上是随机的。但是有时官方急需某个项目的数据,会优先分配急需的任务。

问(03):不同的项目出现不同的萤幕保护画面吗?
:是的!

问(04):运算完后,客户端下面显示出Agent is idle to device profile setting...字样?

  1.请检查您的网路连接状况,包括网路线、网路卡、防火墙等...
  2.如果您是用代理伺服器,请检查设置是否在正确。

问(05):WCG能改为支持HT、多核心运算吗?
:有支援。如果您要调整CPU占用率,请下载WCGridMaxCPU.exe调节。

问(06):WCG的积分大约多久更新一次呢?
:每天更新四次,00:00、06:00、12:00、18:00,此时官方在个人资料方面也无法查看。

问(07):系统要安装,或者复制到其他硬碟,WCG需要做备份吗?
:客户端可以无限制的卸载、重装,对您的贡献积分不会有任何影响!只会损失目前正在计算但是尚未计算完毕的任务包,但这不会对整个项目产生什么影响。
PS:您也可在重装前将整个 WCG 文件夹拷贝出来,然后在重装系统后重装 WCG 覆盖您备份出来的文件夹。

问(08):使用WCGridMaxCPU.exe调节CPU占用率调整为100%,会不会烧掉CPU?
:在不超频及注意散热的情况下,未传出确实的案例。

问(09):WCG在Vista下能正常运行吗?

  1.到W.C.G. 网页http://www.worldcommunit...index.jsp
  2.登入帐号,到My Projects
靠下方还有多一个勾的选项
If there is no work available for my computer for the projects I have selected above, please send me work from another project (this option only applies to BOINC agents). 不要勾。

问(10):接任务后,运算1.2个小时后Task Execution Progress还是显示0% ?

  1.按 Ctrl + Alt + Del 键 --> 点选 "处理程序"
  2.查看"WCGrid_AutoDock.EXE"程式的 CPU 使用率是否有跳动。就可知道该程式有在工作。
(某些任务需较长运算时间,请您安心交给电脑去烦恼!)

问(11):好不容易运算出进度后关机,再开机时任务接受时间归零了?
:某些任务无法接续运算(例“FightAIDS@Home”计划中的某些档),请关机前审慎衡量。

问(12):WorldCommunityGrid (WCG)程序稳定吗?会影响用户要使用其他软体吗?
:此程序非常稳定,不会造成当机等后果。另外它会自动调整对资源的利用。一旦发现用户使用其他软体,它会立即释出电脑资源给用户,所以对用户没有任何影响。

问(13):使用BOINC模组可以用几个运算项目?与WorldCommunityGrid (WCG)计划相容吗?
:BOINC一次运算二个项目,平台上支援所有分散式运算计划。

问(14):WorldCommunityGrid (WCG)计划可以在 Linux 系统运算吗?
:WCG计划因 IBM 无设想到 Linux 系统,请使用 Linux 系统改用 BOINC 平台插件就可。

问(15):如何看世界排名?团队排名?个人排名?

  国家(地区)排名:http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewStatsByCountryAT.do?sort=points&pageNum=1&numRecordsPerPage=50
  台湾区排名:http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewCountryStatsByMemberAT.do?sort=cpu&countryCode=TW
  世界团队排名:http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewStatsByTeamAT.do?sort=points&pageNum=1&numRecordsPerPage=50
  世界个人排名:http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewStatsByMemberAT.do?sort=cpu&pageNum=1&numRecordsPerPage=50


懒人用模组
问(00):



[ 此文章被Fielding在2007-08-22 16:24重新编辑 ]


献花 x2 回到顶端 [1 楼] From:台湾中华HiNet | Posted:2007-05-12 11:01 |

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