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[分享] 何謂「分散式計算」及「常見問題」  (2008.10月版)
  「分散式計算」是一種把需要進行大量計算的工程數據分割成小塊,由多台電腦分別計算,在上傳運算結果後再統一合併得出數據結論的科學。目前主流的分散式計算平臺,"伯克利開放式網路計算平臺(Berkeley Open Infrastructure for Network Computing,簡稱BOINC)",由加州大學柏克萊分校的電腦學系發展出來的分散式計算系統。

  目前常見的分散式計算項目有,分析地球外無線電信號,從而搜索地球外的生命跡象的SETI@home項目,該項目數據基數很大,超過1000萬位數的質數,是目前世界上最大的分散式計算項目,已有四百萬台電腦加入了此項;同時也有分析計算蛋白質的內部結構和相關藥物的Folding@home項目,該項目大約有十萬餘志願者參加。其他如(星塵的分檢、計算圓周率、疫苗、製藥、數學、密碼、氣象、生態、環境、物理推算、蛋白質、基因等......)。

  這些項目很龐大,需要驚人的計算量,由一臺電腦計算是不可能完成的。即使現在有了計算能力超強的超級電腦,但是一些科研機構的經費卻又十分有限。通常使用世界各地上千萬志願者電腦的閒置計算能力,通過網際網路進行數據傳輸演算。
(以檢驗所有人類染色體為例,它需要一台最先進的 PC 1,000,000 年的計算時間)


  「Mychat數位男女」目前所參與的WorldCommunityGrid (WCG) (世界公共網格)是一個由 IBM 公司資助的公益性的醫學研究項目平臺。

  該平臺目前正在運行的項目如下:
  正在進行中的研究

    1、「全球營養水稻」(Nutritious Rice for the World)(於 2008 年 05 月 12 日啟動)
World Community Grid 「全球營養水稻」項目提供的計算能力將用於幫助編譯一些計算模塊,這些模塊有助於確定能最大程度地提高水稻產量和質量的最佳選項。 [詳細內容]

    2、「征服癌症」(Help Conquer Cancer)(於 2007 年 11 月 06 日啟動)
Ontario Cancer Institute(OCI)、Princess Margaret Hospital 以及 University Health Network 與 World Community Grid 在推動 X 射線晶體學的研究成果方面進行合作,以便增進對癌症及其治療方法的理解。[詳細內容]

    3、「氣候系統分析團隊」( AfricanClimate@Home)(於 2007 年 09 月 03 日啟動)
World Community Grid 與 University of Cape Town「氣候系統分析團隊」的研究人員進行合作,為非洲的特定區域開發更為精確的氣候模型。這項研究成果將作為理解氣候在未來如何變化的基礎,以便使旨在減輕氣候變化負面影響的措施得以更好地實施。[詳細內容]

    4、「發現治療登革熱的藥物」(Discovering Dengue Drugs - Together)(於 2007 年 08 月 21 日啟動)
來自 University of Texas 醫學分部和 University of Chicago 的科學家已經加入到 World Community Grid 研究人員的行列,共同與在發達和發展中國家或地區傳播最為廣泛的一些病毒性疾病作鬥爭。該項目的短期目標是發現能夠治療登革出血熱、丙型肝炎、西尼羅腦炎和黃熱病的最新藥物;這些疾病都是由黃病毒科病毒感染所引起的[詳細內容]

    5、「人類蛋白質組折疊」(Human Proteome Folding)-第 2 階段(於 2006 年 06 月 23 日啟動)
「人類蛋白質組折疊」第 2 階段(HPF2)是第一階段的延續。這個項目的兩個主要目標是:1)獲得特定人類蛋白質和病原體蛋白質更為精細的結構 2)通過進一步開發 Rosetta 軟件結構預測功能,進一步提高蛋白質結構預測的準確性。[詳細內容]

    6、「FightAIDS@Home」(於 2005 年 11 月 21 日啟動)
FightAIDS@Home 項目注重於使用計算方法來確定具有正確的分子外形和化學特徵的新候選藥物,以用於抑制 HIV 蛋白酶。這種方法被稱為「基於結構的藥物設計」,根據 National Institute of General Medical Sciences 的調查,這種方法已經對愛滋病人產生了神奇的效果。詳細內容
  暫停中的研究

    「治療肌肉萎縮症」(Help Cure Muscular Dystrophy)(於 2006 年 12 月 19 日啟動)
World Community Grid 和 Decrypthon 支持的研究人員合作研究 4 萬多種結構已知的蛋白質分子之間的相互作用,特別關注在神經肌肉疾病方面起作用的蛋白質,Decrypthon 是 AFM(French Muscular Dystrophy Association)、CNRS(French National Center for Scientific Research)和 IBM 進行的一項合作研究。這個項目所產生的信息數據庫將幫助研究人員設計分子以抑制或增強特定高分子的結合,希望能發現治療肌肉萎縮症及其他神經肌肉疾病的更好方法。


官方網站:http://www.worldcommunitygrid.org
中國網站:http://www.equn.com/wcg/
官方論壇:http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/index

請注意:Your member name can contain alphanumeric characters (A-Z, 0-9), and !, -, _, and spaces. (註冊時使用的用戶名能包括以下字符:A~Z、a~z、0~9、! 、- 、_ 和空格。)

特别提示:
1、該平臺對内存的占用量比較大,尤其是“FightAIDS@Home”和“Help Defeat Cancer”子項目,所以如果您的電腦暫存小於 512MB,建議您參加其他的醫藥類項目。
2、WCG 核心運算在默認設置下是占用 60% 的 CPU,如果需要調整 CPU 使用率,請配合使用 WCGridMaxCPU.exe 程式。下載地址:http://www.worldcommunitygrid....ridMaxCPU.exe



目前較大且穩定的科學研究項目
Einstein@Home:於2005年(定為世界物理年)的這一年開始的計劃,預計是要找出脈衝星的重力波,驗證愛因斯坦的相對論預測。
LHC@home:由歐洲核子研究中心發起。演算粒子物理實驗及粒子物理學所產生數據。
Predictor@home:由美國 Scripps 研究學會發起。研究蛋白質序列來預測蛋白質結構的分散式計算項目。
Rosetta@home:由美國華盛頓大學發起。是一項關於準確預測和設計蛋白質結構及聚合物的分散式計算項目。其目的即尋找準確預測和設計蛋白質結構及聚合物的方法。
SETI@home:由美國加州大學伯克利分校的空間科學實驗室主辦。分析(波多黎各島)阿雷西博無線電望遠鏡採集的無線電信號,搜尋能夠證實外星智能生物存在的證據。

WCG 宣傳視頻:


[ 此文章被Fielding在2008-10-04 21:05重新編輯 ]

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財富:500 (by mickey97) | 理由: 感謝您大力的協助....嗚~~~~~~(眼角泛著淚光)



獻花 x3 回到頂端 [樓 主] From:臺灣中華HiNet | Posted:2007-05-12 10:07 |
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「分散式計算」常見問題
問(01):「分散式計算」伺服現象狀況


問(02):任務的選擇,是不是隨機的呢?
:理論上是随機的。但是有時官方急需某個項目的數據,會優先分配急需的任務。

問(03):不同的項目出現不同的螢幕保護畫面嗎?
:是的!

問(04):運算完後,客戶端下面顯示出Agent is idle to device profile setting...字樣?

  1.請檢查您的網路連接狀況,包括網路線、網路卡、防火牆等...
  2.如果您是用代理伺服器,請檢查設置是否在正確。

問(05):WCG能改爲支持HT、多核心運算嗎?
:有支援。如果您要調整CPU佔用率,請下載WCGridMaxCPU.exe調節。

問(06):WCG的積分大約多久更新一次呢?
:每天更新四次,00:00、06:00、12:00、18:00,此時官方在個人資料方面也無法查看。

問(07):系統要安裝,或者複製到其他硬碟,WCG需要做備份嗎?
:客戶端可以無限制的卸載、重裝,對您的貢獻積分不會有任何影響!只會損失目前正在計算但是尚未計算完畢的任務包,但這不會對整個項目産生什麽影響。
PS:您也可在重裝前將整個 WCG 文件夾拷貝出來,然後在重裝系統後重裝 WCG 覆蓋您備份出來的文件夾。

問(08):使用WCGridMaxCPU.exe調節CPU佔用率調整為100%,會不會燒掉CPU?
:在不超頻及注意散熱的情況下,未傳出確實的案例。

問(09):WCG在Vista下能正常運行嗎?

  1.到W.C.G. 網頁http://www.worldcommunit...index.jsp
  2.登入帳號,到My Projects
靠下方還有多一個勾的選項
If there is no work available for my computer for the projects I have selected above, please send me work from another project (this option only applies to BOINC agents). 不要勾。

問(10):接任務後,運算1.2個小時後Task Execution Progress還是顯示0% ?

  1.按 Ctrl + Alt + Del 鍵 --> 點選 "處理程序"
  2.查看"WCGrid_AutoDock.EXE"程式的 CPU 使用率是否有跳動。就可知道該程式有在工作。
(某些任務需較長運算時間,請您安心交給電腦去煩惱!)

問(11):好不容易運算出進度後關機,再開機時任務接受時間歸零了?
:某些任務無法接續運算(例“FightAIDS@Home”計劃中的某些檔),請關機前審慎衡量。

問(12):WorldCommunityGrid (WCG)程序穩定嗎?會影響用戶要使用其他軟體嗎?
:此程序非常穩定,不會造成當機等後果。另外它會自動調整對資源的利用。一旦發現用戶使用其他軟體,它會立即釋出電腦資源給用戶,所以對用戶沒有任何影響。

問(13):使用BOINC模組可以用幾個運算項目?與WorldCommunityGrid (WCG)計劃相容嗎?
:BOINC一次運算二個項目,平台上支援所有分散式運算計劃。

問(14):WorldCommunityGrid (WCG)計劃可以在 Linux 系統運算嗎?
:WCG計劃因 IBM 無設想到 Linux 系統,請使用 Linux 系統改用 BOINC 平台插件就可。

問(15):如何看世界排名?團隊排名?個人排名?

  國家(地區)排名:http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewStatsByCountryAT.do?sort=points&pageNum=1&numRecordsPerPage=50
  台灣區排名:http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewCountryStatsByMemberAT.do?sort=cpu&countryCode=TW
  世界團隊排名:http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewStatsByTeamAT.do?sort=points&pageNum=1&numRecordsPerPage=50
  世界個人排名:http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewStatsByMemberAT.do?sort=cpu&pageNum=1&numRecordsPerPage=50


懶人用模組
問(00):



[ 此文章被Fielding在2007-08-22 16:24重新編輯 ]


獻花 x2 回到頂端 [1 樓] From:臺灣中華HiNet | Posted:2007-05-12 11:01 |

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