祝由之法，即包括中草藥在內的，借符咒禁禳來治療疾病的一種方法。“祝”者咒也，“由”者病的原由也。“祝由”的概念很廣，包括禁法、咒法、祝法、符法，以及暗示療法、心理療法、催眠療法、音樂療法等，並非僅僅祝其病由而愈其病。有些病原因已明，可是祝之不愈，這說明祝法不起作用，就要改用禁法，或符法，或配合藥物治療。

祝由的治病的原理
人食天地之氣以生，內傷於喜怒憂思悲恐驚七情，外傷於風寒暑濕燥火六淫所以生病。然而，黃帝曰：“其無所遇邪氣，又無怵惕之所志，卒然而病者，其何致 ? ”可見古人很早就認識到，除了七情、六淫外，還有尚未被認識的治病因素，那就是“鬼神致病說”，所謂鬼神致病，其實是一種心理因素所致的疾病，鬼神是不存在的。
古人曰：“吾心無鬼，鬼何以侵之，吾心無邪，邪何以擾之，吾心無魔，魔何以襲之。”故鬼神致病皆由心生。祝由治療疾病的病因大多是心理不健全，故七情、六淫相乘而襲之。有很多種病，是間接由心理因素所致，所以其源在於心。祝由治療腫瘤是大家公認的，但也局限在心理所致的腫瘤，而並非所有的腫瘤都可以治。有很多器質性病變也是由心理因素所致。所以，這些器官或組織產生的病變祝由亦可治。從氣功的角度講，人體患病無非是心病和身病。心病是祝由治療的範圍，部分身病也屬於祝由治療的範圍，但祝由並非包治一切“心病”，要理解到祝由僅僅是醫學的補充，不是治病的唯一手段。
隨著科學技術的不斷發展，有很多種病，已經攻克，但有些病仍未找到合適的治療方法，這也是祝由科流傳幾千年仍未滅絕的原因。