一直以來，科學家就百慕達三角之謎都有很多解說，以下是部份較可取信的說法。

>亞特蘭大陸說

百慕達三角洲所涵蓋的區域居然包含了北比米尼壁，科學家認為是亞特大遺址的區域就是於此。於是有人推測，由於亞特蘭大有極高度的文明，且據記載是毀滅於自己的文明， 所以極有可能亞特蘭大人有不為現代人所知的武器系統（如類似核彈的毀滅性武器），或是特殊能源（如電磁能），所發現的巨大海底金字塔也許正是亞特蘭人的建築物，或許它就是一座能量產生廠。 而在亞特蘭大陸沉沒以後，這些具有磁場或放射能的遺蹟在海水中仍然能產生足以影響現今交通工具電子設備的能量，於是造成儀表失靈，羅盤亂轉等不正常現象。但此說卻無法解釋那些人員失蹤而船舶卻完好的案件。  

>四度空間

另有一派說法是這些失蹤的 航具是在一瞬間掉進了時間的洞，而到了另一個時空之中，所以沒有辦法找 到一絲殘頦。而產生這洞的原因正是磁場。事實上美國在1943年曾經秘密做 過一次實驗，就是著名的; 費城實驗。美軍在一軍事港口上裝置了強力的磁 場產生機，而船則停靠在港灣中。當試驗開始，磁力機運轉，大家都注意到 一輪光芒開始包覆著整艘船。漸漸地船在眾目睽睽之下開始消失，廣播器中 傳來艦上人員的悽厲的叫聲。指揮官下令立刻終止實驗。多年後，凡是當時 在艦上的船員都陸續死亡，即使存活的人也是痛苦不堪。有的人甚至會在眾 人面前突然消失，然後又突然出現。強大的磁場會造成空間的交錯，產生奇 妙的光芒，這不正符合一些百慕達三角洲的神秘特色? 但果真如此，能量的 真正來源又是什麼呢? 難道又是那神秘的海底金字塔嗎?

>外太空生物

由於UFO的目擊報告不斷， 乃有人主張是外星人擄走了那些失蹤的人。外星人為了研究地球的生命及 科技，擄掠人畜的情形不是沒有，最有名的要算是家畜虐殺事件。所以依據 這種說法，外星人利用時空轉移法連人帶機或整艘船，傳送出地球，到達另 一個星球，自然不會留下任何線索及痕跡，似乎解釋了所有的疑團，但外星 人為何要那麼固執持續在這塊區域從事這個活動，而不到其它偏遠一點的海域呢 ?

>海底世界

人類對於大海的瞭解其實是 十分的稀少，海深超過2000公尺的深海區域就已經是人類科技難以到達的深 海處，而地球平均海深約3700公尺，馬里亞那海溝用聲納探測就已超過15000 公尺。1960年代出現在百慕達三角海域附近，西印度群島海域的“腔棘魚” 是在三億年前就出現在地球上的生物，它的被大舉發現在這個區域似乎意味 著甚麼，為什麼比恐龍還要早兩億多年就出現在地球上的生物竟然存活至今 ，存活在這個魔鬼的海域，是否深海的某處有所謂的海底世界，貫穿了過去 與未來...