用藥禁忌主要有以下几個方面：

　　1．配伍禁忌： 前面“配伍”一節中曾原則地提到，在复方配伍中，有些藥物應避免合用。《神農本草經》稱這些藥物之間的關系為“相惡”和“相反”。据《蜀本草》統計，《本經》所載藥物中，相惡的有六十种，而相反的則有十八种。歷代關于配伍禁忌的認識和發展，在古籍中說法并不一致。金元時期概括為“十九畏”和“十八反”，并編成歌訣，現將歌訣內容列舉于下。

　　（1）十九畏：

　　硫黃畏朴硝，水銀畏砒霜，狼毒畏密陀僧，巴豆畏牽牛，丁香畏郁金，川烏、草烏畏犀角，牙硝畏三棱，官桂畏石脂，人參畏五靈脂。

　　（2）十八反：

　　甘草反甘遂、大戟、海藻、芫花；烏頭反貝母、瓜萎、半夏、白蘞、白及；藜蘆反人參、沙參、丹參、玄參、細辛、芍藥。

　　此后的《本草綱目》及《藥鑒》等書所記，略有出入，但不如十八反、十九畏歌那樣普遍認可和傳播習誦。

　　《神農本草經‧序例》指出“勿用相惡、相反者”，“若有毒宜制，可用相畏、相殺者爾，勿合用也”。自宋代以后，將“相畏”關系也列為配伍禁忌，与“相惡”混淆不清。因此，“十九畏”的概念，与“配伍”一節中所談的“七情”之一的“相畏”，涵義并不相同。

　　“十九畏”和“十八反”諸藥，有一部分同實際應用有些出入，歷代醫家也有所論及，引古方為据，証明某些藥物仍然可以合用。如感應丸中的巴豆与牽牛同用；甘遂半夏湯以甘草同甘遂并列；散腫潰堅湯、海藻玉壺湯等均合用甘草和海藻；十香返魂丹是將丁香、郁金同用；大活絡丹烏頭与犀角同用等等。現代這方面的研究工作做得不多，有些實驗研究初步表明，如甘草、甘遂兩种藥合用時，毒性的大小主要取決于甘草的用量比例，甘草的劑量若相等或大于甘遂，毒性較大；又如貝母和半夏分別与烏頭配伍，未見明顯的增強毒性。而細辛配伍藜蘆，則可導致實驗動物中毒死亡。由于對“十九畏”和“十八反”的研究，還有待進一步作較深入的實驗和觀察，并研究其机理，因此，目前應采取慎重態度。一般說來，對于其中一些藥物，若無充分根据和應用經驗，仍須避免盲目配合應用。

　　2．妊娠用藥禁忌： 某些藥物具有損害胎元以致墮胎的副作用，所以應該作為妊娠禁忌的藥物。根据藥物對于胎元損害程度的不同，一般可分為禁用与慎用二類。禁用的大多是毒性較強，或藥性猛烈的藥物，如巴豆、牽牛、大戟、斑蝥、商陸、麝香、三棱、莪術、水蛭、虻虫等；慎用的包括通經去瘀、行气破滯，以及辛熱等藥物，如桃仁、紅花、大黃、枳實、附子、干姜、肉桂等。凡禁用的藥物，絕對不能使用；慎用的藥物，則可根据孕婦患病的情況，斟情使用。但沒有特殊必要時，應盡量避免，以防發生事故。

　　3．服藥時的飲食禁忌： 飲食禁忌簡稱食忌，也就是通常所說的忌口。在古代文獻上有常山忌蔥；地黃、何首烏忌蔥、蒜、蘿卜，薄荷忌鱉肉；茯苓忌醋；鱉甲忌莧菜：以及蜜反生蔥等記載。這說明服用某些藥時不可同吃某些食物。另外，由于疾病的關系，在服藥期間，凡屬生冷、粘膩、腥臭等不易消化及有特殊刺激性的食物，都應根据需要予以避免。高燒患者還應忌油。