肥厚性幽門狹窄是因為幽門肌肉異常肥大造成胃出口阻塞，造成此肌肉異常肥大的原因仍不知。
症狀：出生後二到六週開始出現噴射狀嘔吐，嘔吐物不含(黃色)膽汁。病兒食慾仍在，但嘔吐越來越厲害。時間久了，水份及營養皆缺。

診斷：上腹部可觸摸到橄欖狀硬塊(肥大的幽門肌肉)，腹部 X 光及超音波可幫忙診斷。通常不必上消化道鋇劑攝影即可診斷。

治療：病人因胃液流失，容易產生鹼中毒及電解質失衡，故要檢查和校正血中pH及電解質。補充水份至適當排尿量。以胃管排空胃液。手術是把幽門肌肉切開。術後一兩天可能仍有嘔吐現象，但大多可嘗試進食。

併發症：手術中可能切破十二指腸黏膜。幽門肌肉切開不夠而症狀持續，但這情形不常見。